С 1989 года лабораторией заведует Б.И. Сандухадзе. В 80-90-е годы под руководством Б.И. Сандухадзе по разработанной им схеме с применением метода прерывающихся беккроссов и использованием донора короткостебельности Краснодарского Карлика 1 получены сорта с потенциалом урожайности до 8-10 т/га. Создание сортов нового морфотипа – короткостебельных, устойчивых к полеганию – стало настоящим прорывом в селекции озимой пшеницы. За последние 30 лет урожайность этой культуры в Нечерноземье удвоилась.
Один за другим производству передавались сорта: Инна, Памяти Федина, Московская 39, Галина, Немчиновская 24, Московская 56, Немчиновская 57, Московская 40, Немчиновская 17. Среди них выделяется уникальный сорт Московская 39. При средней урожайности в производственных условиях 5,5-6,0 т/га (потенциал свыше10 т/га) его зерно содержит 14-15% белка и 30-32% клейковины. Достичь такого сочетания селекционным путем в центре Нечерноземья не удавалось еще никому, качество зерна соответствует категории сильной пшеницы.
По итогам Международного испытания сортов озимой пшеницы в Канаде в 1998-2000 гг. сорт Московская 39 был признан лучшим. Он удостоен золотых медалей на выставках «Золотая осень – 2005», «Лучший продукт Подмосковья – 2007», «День российского поля – 2008».
С появлением Московской 39 опровергнуто бытовавшее многие годы мнение, что пшеница в Нечерноземной зоне не может быть пригодной для хлебопечения. Центральный регион стал производителем собственного продовольственного зерна озимой пшеницы.
Ареал возделывания Московской 39 постоянно расширяется. Сорт пользуется спросом даже в южных, основных районах производства озимой пшеницы.
Посевная площадь под Немчиновскими сортами озимой пшеницы превышает 2,5 млн. га.
Селекционные исследования направлены на повышение технологичности новых сортов за счет короткостебельности, качества зерна и сокращения сроков вегетации, что особенно важно для Нечерноземья. Уже созданы линии, созревающие на 5-6 дней раньше стандарта.
Лаборатория большое внимание уделяет семеноводству: ежегодно реализуется свыше 300 тонн оригинальных семян, с десятками хозяйств заключены лицензионные договора на производство элиты и суперэлиты с постоянной апробацией семенных посевов.